Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GNPDA1P46926 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA1P46926 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms