Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP13P45452 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP13P45452 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP13P45452 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP13P45452 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP13P45452 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP13P45452 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP13P45452 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP13P45452 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP13P45452 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP13P45452 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP13P45452 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP13P45452 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP13P45452 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP13P45452 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP13P45452 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP13P45452 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP13P45452 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP13P45452 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP13P45452 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP13P45452 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP13P45452 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP13P45452 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP13P45452 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP13P45452 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP13P45452 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP13P45452 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP13P45452 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP13P45452 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP13P45452 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP13P45452 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP13P45452 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP13P45452 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP13P45452 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP13P45452 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP13P45452 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP13P45452 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP13P45452 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP13P45452 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP13P45452 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP13P45452 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP13P45452 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP13P45452 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP13P45452 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP13P45452 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP13P45452 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP13P45452 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP13P45452 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP13P45452 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP13P45452 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP13P45452 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP13P45452 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP13P45452 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP13P45452 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP13P45452 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP13P45452 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP13P45452 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP13P45452 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP13P45452 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP13P45452 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP13P45452 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP13P45452 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP13P45452 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP13P45452 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP13P45452 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP13P45452 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP13P45452 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP13P45452 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP13P45452 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP13P45452 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP13P45452 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP13P45452 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP13P45452 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP13P45452 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP13P45452 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP13P45452 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP13P45452 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP13P45452 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP13P45452 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP13P45452 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP13P45452 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP13P45452 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms