Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3AP31941 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms