Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD1P28289 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD1P28289 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD1P28289 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms