Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A1P22736 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A1P22736 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms