Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB2P22676 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB2P22676 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB2P22676 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB2P22676 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB2P22676 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB2P22676 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB2P22676 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB2P22676 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB2P22676 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB2P22676 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB2P22676 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB2P22676 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB2P22676 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB2P22676 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB2P22676 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB2P22676 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB2P22676 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB2P22676 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB2P22676 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB2P22676 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB2P22676 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB2P22676 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB2P22676 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB2P22676 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB2P22676 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB2P22676 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB2P22676 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB2P22676 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB2P22676 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB2P22676 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB2P22676 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB2P22676 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB2P22676 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB2P22676 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB2P22676 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB2P22676 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB2P22676 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB2P22676 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB2P22676 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB2P22676 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB2P22676 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB2P22676 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB2P22676 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms