Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF3P20783 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF3P20783 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF3P20783 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF3P20783 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTF3P20783 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTF3P20783 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTF3P20783 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTF3P20783 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTF3P20783 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF3P20783 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF3P20783 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF3P20783 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTF3P20783 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF3P20783 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF3P20783 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF3P20783 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF3P20783 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF3P20783 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF3P20783 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF3P20783 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF3P20783 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF3P20783 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF3P20783 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF3P20783 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF3P20783 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF3P20783 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF3P20783 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF3P20783 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF3P20783 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF3P20783 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTF3P20783 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTF3P20783 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTF3P20783 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTF3P20783 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTF3P20783 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTF3P20783 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTF3P20783 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTF3P20783 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTF3P20783 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTF3P20783 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTF3P20783 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NTF3P20783 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTF3P20783 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTF3P20783 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms