Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCLP18206 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VCLP18206 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCLP18206 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCLP18206 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCLP18206 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCLP18206 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCLP18206 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCLP18206 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCLP18206 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VCLP18206 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VCLP18206 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VCLP18206 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCLP18206 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCLP18206 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCLP18206 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCLP18206 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VCLP18206 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCLP18206 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCLP18206 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCLP18206 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VCLP18206 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCLP18206 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCLP18206 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VCLP18206 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCLP18206 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCLP18206 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VCLP18206 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCLP18206 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCLP18206 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCLP18206 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCLP18206 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VCLP18206 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VCLP18206 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VCLP18206 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCLP18206 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCLP18206 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCLP18206 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCLP18206 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCLP18206 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCLP18206 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCLP18206 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCLP18206 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCLP18206 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCLP18206 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCLP18206 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms