Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPCAMP16422 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPCAMP16422 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms