Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VDRP11473 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VDRP11473 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VDRP11473 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VDRP11473 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VDRP11473 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VDRP11473 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VDRP11473 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VDRP11473 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VDRP11473 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VDRP11473 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VDRP11473 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VDRP11473 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VDRP11473 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VDRP11473 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VDRP11473 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VDRP11473 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VDRP11473 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VDRP11473 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VDRP11473 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VDRP11473 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VDRP11473 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VDRP11473 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VDRP11473 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VDRP11473 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VDRP11473 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VDRP11473 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VDRP11473 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VDRP11473 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VDRP11473 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VDRP11473 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VDRP11473 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VDRP11473 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VDRP11473 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VDRP11473 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VDRP11473 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VDRP11473 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VDRP11473 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VDRP11473 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VDRP11473 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VDRP11473 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VDRP11473 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VDRP11473 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VDRP11473 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VDRP11473 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VDRP11473 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VDRP11473 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VDRP11473 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VDRP11473 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VDRP11473 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VDRP11473 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VDRP11473 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VDRP11473 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VDRP11473 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VDRP11473 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VDRP11473 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VDRP11473 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VDRP11473 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VDRP11473 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VDRP11473 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VDRP11473 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VDRP11473 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VDRP11473 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VDRP11473 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VDRP11473 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VDRP11473 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VDRP11473 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VDRP11473 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VDRP11473 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VDRP11473 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VDRP11473 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VDRP11473 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VDRP11473 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms