Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms