Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L7P0C7H9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L7P0C7H9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms