Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB40ALP0C0E4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40ALP0C0E4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms