Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHEP01854 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHEP01854 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHEP01854 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHEP01854 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHEP01854 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHEP01854 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHEP01854 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHEP01854 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHEP01854 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHEP01854 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHEP01854 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHEP01854 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHEP01854 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHEP01854 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHEP01854 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHEP01854 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHEP01854 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHEP01854 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHEP01854 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHEP01854 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHEP01854 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHEP01854 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHEP01854 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHEP01854 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHEP01854 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHEP01854 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHEP01854 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHEP01854 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHEP01854 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHEP01854 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHEP01854 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHEP01854 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHEP01854 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHEP01854 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHEP01854 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHEP01854 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHEP01854 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHEP01854 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHEP01854 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHEP01854 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHEP01854 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHEP01854 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHEP01854 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHEP01854 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHEP01854 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGHEP01854 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHEP01854 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHEP01854 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHEP01854 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHEP01854 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHEP01854 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHEP01854 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHEP01854 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHEP01854 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHEP01854 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHEP01854 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHEP01854 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHEP01854 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHEP01854 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHEP01854 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHEP01854 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHEP01854 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHEP01854 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHEP01854 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1037.6 ms