Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACTL6AO96019 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTL6AO96019 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTL6AO96019 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms