Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK4O96013 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK4O96013 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK4O96013 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK4O96013 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAK4O96013 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAK4O96013 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAK4O96013 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAK4O96013 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAK4O96013 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAK4O96013 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAK4O96013 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAK4O96013 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAK4O96013 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAK4O96013 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAK4O96013 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAK4O96013 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAK4O96013 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAK4O96013 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAK4O96013 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAK4O96013 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAK4O96013 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PAK4O96013 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAK4O96013 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAK4O96013 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAK4O96013 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAK4O96013 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAK4O96013 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAK4O96013 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAK4O96013 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAK4O96013 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAK4O96013 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAK4O96013 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAK4O96013 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PAK4O96013 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAK4O96013 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAK4O96013 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAK4O96013 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAK4O96013 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAK4O96013 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAK4O96013 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAK4O96013 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAK4O96013 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAK4O96013 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAK4O96013 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAK4O96013 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAK4O96013 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAK4O96013 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAK4O96013 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAK4O96013 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAK4O96013 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAK4O96013 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAK4O96013 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAK4O96013 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAK4O96013 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAK4O96013 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAK4O96013 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAK4O96013 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAK4O96013 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAK4O96013 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAK4O96013 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAK4O96013 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAK4O96013 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAK4O96013 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAK4O96013 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAK4O96013 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAK4O96013 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAK4O96013 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAK4O96013 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAK4O96013 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAK4O96013 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAK4O96013 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAK4O96013 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAK4O96013 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAK4O96013 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAK4O96013 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAK4O96013 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAK4O96013 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAK4O96013 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAK4O96013 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAK4O96013 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAK4O96013 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAK4O96013 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAK4O96013 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms