Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24AO95486 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24AO95486 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24AO95486 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms