Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A2O94788 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A2O94788 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A2O94788 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A2O94788 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A2O94788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A2O94788 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALDH1A2O94788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ALDH1A2O94788 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A2O94788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A2O94788 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms