Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB3O75712 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB3O75712 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB3O75712 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB3O75712 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB3O75712 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB3O75712 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB3O75712 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB3O75712 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB3O75712 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB3O75712 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB3O75712 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB3O75712 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB3O75712 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB3O75712 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB3O75712 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB3O75712 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB3O75712 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB3O75712 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB3O75712 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB3O75712 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB3O75712 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB3O75712 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB3O75712 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB3O75712 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB3O75712 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB3O75712 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB3O75712 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB3O75712 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB3O75712 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB3O75712 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB3O75712 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB3O75712 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB3O75712 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB3O75712 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB3O75712 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB3O75712 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB3O75712 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB3O75712 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB3O75712 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB3O75712 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB3O75712 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB3O75712 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB3O75712 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB3O75712 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB3O75712 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB3O75712 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB3O75712 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB3O75712 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB3O75712 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB3O75712 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB3O75712 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB3O75712 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB3O75712 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB3O75712 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB3O75712 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB3O75712 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB3O75712 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB3O75712 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB3O75712 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB3O75712 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB3O75712 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB3O75712 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB3O75712 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB3O75712 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB3O75712 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB3O75712 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB3O75712 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB3O75712 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB3O75712 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB3O75712 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB3O75712 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB3O75712 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB3O75712 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB3O75712 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB3O75712 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB3O75712 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB3O75712 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB3O75712 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB3O75712 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB3O75712 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB3O75712 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB3O75712 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB3O75712 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB3O75712 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB3O75712 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB3O75712 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms