Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA10O75578 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms