Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SS18L1O75177 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SS18L1O75177 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SS18L1O75177 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SS18L1O75177 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SS18L1O75177 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SS18L1O75177 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SS18L1O75177 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SS18L1O75177 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SS18L1O75177 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SS18L1O75177 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SS18L1O75177 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SS18L1O75177 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SS18L1O75177 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SS18L1O75177 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SS18L1O75177 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SS18L1O75177 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SS18L1O75177 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SS18L1O75177 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SS18L1O75177 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SS18L1O75177 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SS18L1O75177 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SS18L1O75177 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SS18L1O75177 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SS18L1O75177 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SS18L1O75177 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SS18L1O75177 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SS18L1O75177 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SS18L1O75177 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SS18L1O75177 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SS18L1O75177 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SS18L1O75177 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SS18L1O75177 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SS18L1O75177 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SS18L1O75177 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SS18L1O75177 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SS18L1O75177 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms