Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN2BO60939 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms