Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOBOXO60393 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms