Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3LO60238 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNIP3LO60238 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms