Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF1CO43896 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF1CO43896 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms