Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGTAO43765 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGTAO43765 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGTAO43765 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGTAO43765 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGTAO43765 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGTAO43765 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGTAO43765 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGTAO43765 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGTAO43765 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SGTAO43765 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGTAO43765 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGTAO43765 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGTAO43765 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGTAO43765 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGTAO43765 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGTAO43765 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGTAO43765 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGTAO43765 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGTAO43765 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGTAO43765 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGTAO43765 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGTAO43765 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGTAO43765 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGTAO43765 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGTAO43765 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGTAO43765 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGTAO43765 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGTAO43765 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGTAO43765 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGTAO43765 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGTAO43765 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SGTAO43765 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGTAO43765 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGTAO43765 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGTAO43765 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGTAO43765 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGTAO43765 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGTAO43765 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGTAO43765 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGTAO43765 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGTAO43765 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGTAO43765 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGTAO43765 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGTAO43765 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGTAO43765 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGTAO43765 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGTAO43765 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGTAO43765 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGTAO43765 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGTAO43765 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGTAO43765 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGTAO43765 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGTAO43765 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGTAO43765 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGTAO43765 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGTAO43765 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGTAO43765 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGTAO43765 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGTAO43765 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGTAO43765 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGTAO43765 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGTAO43765 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGTAO43765 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGTAO43765 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGTAO43765 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGTAO43765 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGTAO43765 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGTAO43765 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGTAO43765 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGTAO43765 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGTAO43765 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGTAO43765 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGTAO43765 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGTAO43765 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGTAO43765 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGTAO43765 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGTAO43765 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGTAO43765 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGTAO43765 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGTAO43765 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGTAO43765 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGTAO43765 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGTAO43765 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SGTAO43765 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGTAO43765 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGTAO43765 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGTAO43765 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGTAO43765 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms