Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN6O43657 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms