Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMM44O43615 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMM44O43615 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TIMM44O43615 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms