Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTIFO43310 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTIFO43310 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTIFO43310 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTIFO43310 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTIFO43310 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTIFO43310 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTIFO43310 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTIFO43310 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTIFO43310 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTIFO43310 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTIFO43310 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTIFO43310 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTIFO43310 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTIFO43310 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTIFO43310 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTIFO43310 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTIFO43310 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTIFO43310 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTIFO43310 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTIFO43310 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTIFO43310 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTIFO43310 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTIFO43310 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTIFO43310 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTIFO43310 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTIFO43310 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTIFO43310 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CTIFO43310 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTIFO43310 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTIFO43310 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTIFO43310 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTIFO43310 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTIFO43310 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTIFO43310 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTIFO43310 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTIFO43310 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTIFO43310 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTIFO43310 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTIFO43310 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTIFO43310 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTIFO43310 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTIFO43310 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTIFO43310 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTIFO43310 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTIFO43310 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTIFO43310 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTIFO43310 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTIFO43310 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTIFO43310 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CTIFO43310 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTIFO43310 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTIFO43310 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTIFO43310 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTIFO43310 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTIFO43310 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTIFO43310 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTIFO43310 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTIFO43310 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTIFO43310 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTIFO43310 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTIFO43310 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTIFO43310 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTIFO43310 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTIFO43310 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTIFO43310 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTIFO43310 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTIFO43310 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTIFO43310 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTIFO43310 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTIFO43310 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTIFO43310 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTIFO43310 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTIFO43310 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTIFO43310 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTIFO43310 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTIFO43310 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTIFO43310 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTIFO43310 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTIFO43310 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTIFO43310 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTIFO43310 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTIFO43310 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTIFO43310 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTIFO43310 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTIFO43310 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTIFO43310 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTIFO43310 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTIFO43310 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CTIFO43310 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTIFO43310 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
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