Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC7A4O43246 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC7A4O43246 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms