Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP8O43159 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP8O43159 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP8O43159 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP8O43159 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP8O43159 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP8O43159 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP8O43159 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP8O43159 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP8O43159 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP8O43159 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP8O43159 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP8O43159 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP8O43159 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP8O43159 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP8O43159 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP8O43159 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP8O43159 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP8O43159 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP8O43159 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP8O43159 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP8O43159 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP8O43159 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP8O43159 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP8O43159 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP8O43159 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP8O43159 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP8O43159 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP8O43159 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP8O43159 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP8O43159 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP8O43159 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP8O43159 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP8O43159 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP8O43159 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP8O43159 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP8O43159 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP8O43159 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP8O43159 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP8O43159 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP8O43159 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP8O43159 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP8O43159 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP8O43159 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP8O43159 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP8O43159 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP8O43159 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP8O43159 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP8O43159 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP8O43159 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP8O43159 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP8O43159 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP8O43159 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP8O43159 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP8O43159 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP8O43159 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP8O43159 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP8O43159 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP8O43159 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP8O43159 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP8O43159 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP8O43159 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP8O43159 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP8O43159 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms