Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A3R1O14745 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A3R1O14745 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A3R1O14745 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms