Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA2E9PIF3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA2E9PIF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPA2E9PIF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms