Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L21D6R901 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L21D6R901 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP17L21D6R901 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L21D6R901 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms