Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
B4E1Z4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
B4E1Z4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4E1Z4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4E1Z4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4E1Z4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4E1Z4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4E1Z4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4E1Z4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4E1Z4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4E1Z4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4E1Z4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4E1Z4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
B4E1Z4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
B4E1Z4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4E1Z4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
B4E1Z4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4E1Z4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4E1Z4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
B4E1Z4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
B4E1Z4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
B4E1Z4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
B4E1Z4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
B4E1Z4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
B4E1Z4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
B4E1Z4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
B4E1Z4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
B4E1Z4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
B4E1Z4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
B4E1Z4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
B4E1Z4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
B4E1Z4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
B4E1Z4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
B4E1Z4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
B4E1Z4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
B4E1Z4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
B4E1Z4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
B4E1Z4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4E1Z4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4E1Z4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
B4E1Z4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4E1Z4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4E1Z4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4E1Z4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
B4E1Z4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
B4E1Z4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
B4E1Z4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
B4E1Z4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4E1Z4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4E1Z4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4E1Z4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4E1Z4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
B4E1Z4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
B4E1Z4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
B4E1Z4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
B4E1Z4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
B4E1Z4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
B4E1Z4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
B4E1Z4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
B4E1Z4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4E1Z4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4E1Z4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4E1Z4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4E1Z4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4E1Z4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4E1Z4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4E1Z4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4E1Z4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4E1Z4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4E1Z4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4E1Z4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4E1Z4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4E1Z4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
B4E1Z4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
B4E1Z4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
B4E1Z4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4E1Z4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4E1Z4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4E1Z4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4E1Z4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4E1Z4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4E1Z4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
B4E1Z4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms