Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DGG1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DGG1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DGG1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4DGG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4DGG1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B4DGG1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4DGG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4DGG1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4DGG1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4DGG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DGG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DGG1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DGG1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DGG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DGG1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DGG1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DGG1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4DGG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DGG1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DGG1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DGG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DGG1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DGG1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DGG1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DGG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DGG1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DGG1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DGG1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DGG1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DGG1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DGG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DGG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DGG1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DGG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DGG1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DGG1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4DGG1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4DGG1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4DGG1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4DGG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4DGG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DGG1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DGG1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
B4DGG1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B4DGG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B4DGG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4DGG1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4DGG1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4DGG1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4DGG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DGG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DGG1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DGG1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DGG1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DGG1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DGG1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DGG1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DGG1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DGG1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DGG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DGG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DGG1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DGG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DGG1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DGG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DGG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DGG1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DGG1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4DGG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4DGG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4DGG1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4DGG1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms