Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP5A6NIR3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP5A6NIR3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms