Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRAMEF22A3QJZ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRAMEF22A3QJZ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms