Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLRN2A0PK11 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLRN2A0PK11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLRN2A0PK11 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms