Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A0A0J9YXV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms