Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV23-1A0A0A0MS06 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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TRBV23-1A0A0A0MS06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV23-1A0A0A0MS06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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