Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms