Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms