Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms