Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms