Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms