Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH11P55287 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH11P55287 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms