Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPIND1P05546 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms