Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC9A8Q9Y2E8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A8Q9Y2E8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms