Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AMBRA1Q9C0C7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AMBRA1Q9C0C7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AMBRA1Q9C0C7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AMBRA1Q9C0C7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AMBRA1Q9C0C7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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